Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED13Q9UHV7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms