Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
IFT172Q9UG01 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms