Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms