Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms