Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms