Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A13Q9NSD5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms