Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPCPD1Q9NPB8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPCPD1Q9NPB8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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