Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLMPQ9H6B4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms