Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms