Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMBRA1Q9C0C7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms