Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms