Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms