Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS2Q99743 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms