Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCF12Q99081 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms