Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms