Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms