Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms