Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMARCE1Q969G3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms