Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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BRF1Q92994 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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