Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms