Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC4Q8TBB5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms