Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4DQ86TL0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms