Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms