Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC80Q76M96 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms