Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.185e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.145e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.115e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ARHGEF40-203ENST00000554514 2928 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.085e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.065e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.046e-11■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.035e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.025e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.025e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRMT1-203ENST00000524771 713 ntTSL 314.99□□□□□ -0.015e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 314.98□□□□□ -0.015e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-206ENST00000457307 941 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 FAM98A-205ENST00000474985 3546 ntTSL 214.84□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ARHGEF40-207ENST00000556399 4902 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.065e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ARHGEF40-202ENST00000553709 5204 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.075e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ANXA11-206ENST00000447489 750 ntTSL 314.35□□□□□ -0.112e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NDUFS8-206ENST00000525628 515 ntTSL 214.15□□□□□ -0.142e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.155e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.165e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ARHGEF40-208ENST00000557498 794 ntTSL 213.98□□□□□ -0.175e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NDUFS8-212ENST00000531228 531 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.226e-11■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NPLOC4-218ENST00000574964 572 ntTSL 413.62□□□□□ -0.235e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NPLOC4-207ENST00000572346 567 ntTSL 413.62□□□□□ -0.235e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 513.38□□□□□ -0.272e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TALDO1-206ENST00000530666 587 ntTSL 213.37□□□□□ -0.276e-11■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-206ENST00000570500 473 ntTSL 213.32□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-209ENST00000573513 827 ntTSL 513.32□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TACC3-208ENST00000484264 551 ntTSL 213.15□□□□□ -0.36e-11■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRCC-202ENST00000454659 1084 ntTSL 313.1□□□□□ -0.315e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-DBNDD2-204ENST00000475242 529 ntTSL 313.1□□□□□ -0.315e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.325e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.325e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.335e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TSEN54-203ENST00000545228 1139 ntTSL 512.99□□□□□ -0.335e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PGF-208ENST00000557748 875 ntTSL 212.88□□□□□ -0.355e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.46e-11■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 CD276-212ENST00000561176 640 ntTSL 312.53□□□□□ -0.42e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PAM-202ENST00000345721 3684 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.415e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 WDR81-208ENST00000464528 4432 ntTSL 212.38□□□□□ -0.435e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.455e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.455e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-207ENST00000571146 890 ntTSL 312.21□□□□□ -0.455e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.465e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.475e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TSEN54-204ENST00000577197 650 ntTSL 212.05□□□□□ -0.485e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 AGTRAP-213ENST00000513739 566 ntTSL 311.98□□□□□ -0.495e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.55e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.515e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 311.81□□□□□ -0.525e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRMT1-219ENST00000534465 779 ntTSL 311.81□□□□□ -0.525e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NPLOC4-213ENST00000573519 654 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.555e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRMT1-211ENST00000528623 543 ntTSL 311.51□□□□□ -0.575e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRCC-206ENST00000491853 833 ntTSL 311.37□□□□□ -0.595e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.625e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.635e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRCC-207ENST00000526188 634 ntTSL 211.12□□□□□ -0.635e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 HDAC3-204ENST00000469207 829 ntTSL 311.09□□□□□ -0.635e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MRPL48-206ENST00000508278 1560 ntTSL 211.01□□□□□ -0.655e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 510.68□□□□□ -0.75e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-204ENST00000426004 2915 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MRPL48-209ENST00000540162 1004 ntTSL 510.42□□□□□ -0.745e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 AC090004.1-202ENST00000601399 787 ntTSL 510.39□□□□□ -0.755e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.785e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NPLOC4-206ENST00000571714 676 ntTSL 510.02□□□□□ -0.815e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 HDAC3-205ENST00000469550 1952 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.885e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 29.53□□□□□ -0.885e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TALDO1-207ENST00000532202 270 ntTSL 39.52□□□□□ -0.896e-11■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MRPL48-202ENST00000314282 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.95e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.955e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 H2AFY-218ENST00000512507 10982 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.972e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.995e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.995e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -15e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 H2AFY-205ENST00000451949 1744 ntTSL 28.57□□□□□ -1.042e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 AC090004.1-203ENST00000626721 886 ntTSL 58.53□□□□□ -1.045e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 NPLOC4-210ENST00000572824 559 ntTSL 48.33□□□□□ -1.085e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MRPL48-204ENST00000411840 1197 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.095e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 H2AFY-216ENST00000511494 2521 ntTSL 27.67□□□□□ -1.182e-8■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 PAM-205ENST00000379799 2567 ntTSL 57.14□□□□□ -1.275e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 SYS1-208ENST00000479779 1022 ntTSL 26.99□□□□□ -1.295e-6■■□□□ 12.4
LARP4Q71RC2 MGST3-213ENST00000609263 3101 nt5.88□□□□□ -1.475e-6■■□□□ 12.4
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