Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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