Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms