Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms