Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms