Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102BQ68D86 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms