Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms