Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USPL1Q5W0Q7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms