Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PIK3CD-AS1Q5SR53 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms