Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms