Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL12Q53G59 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms