Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms