Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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