Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms