Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNRD1Q16881 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms