Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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