Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD1Q16676 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD1Q16676 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD1Q16676 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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