Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFE2Q16621 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms