Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD2Q16342 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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