Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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