Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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BRD3Q15059 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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