Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
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