Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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