Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPD2Q15021 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
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