Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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