Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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